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Cancer Letters| 苏北人民医院研究发现6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶或可成为肺腺癌潜在的预后生物标志物和治疗靶点

发布时间:2024-11-14

非小细胞肺癌(NSCLC)是导致癌症相关死亡的最常见原因,在NSCLC的各种病理类型中,肺腺癌(LUAD)已成为主要的类型,尽管LUAD治疗不断取得进展,但疗效仍然微乎其微。因此,确定一个明确的LUAD诊断和预后评估的生物学标志物是至关重要的。

2024年10月1日,苏北人民医院Cancer Letters(IF=9.1)上发表题为“6-Phosphogluconate dehydrogenase promotes glycolysis and fatty acid synthesis by inhibiting the AMPK pathway in lung adenocarcinoma cells”的研究文章。本文研究表明,PGD在LUAD中上调,并抑制AMPK通路,从而增强糖酵解和脂肪酸合成,促进肿瘤的恶性进展。因此,靶向PGD是治疗LUAD的一种潜在的治疗策略。该研究成果中拜谱生物为其提供蛋白互作组的检测与分析。

文章名称:6-Phosphogluconate dehydrogenase promotes glycolysis and fatty acid synthesis by inhibiting the AMPK pathway in lung adenocarcinoma cells(Cancer Letters,IF=9.1,2024.10)

客户单位:苏北人民医院

研究材料:IP beads

拜谱提供技术:蛋白互作组分析

技术路线:

研究结果

磷酸戊糖途径(PPP)在LUAD中被显著激活

从6例LUAD患者中收集了1份正常组织样本和12份肿瘤组织样本进行单细胞RNA测序,注释有T细胞、髓系细胞、上皮细胞、B细胞、内皮细胞、成纤维细胞和肥大细胞(图1A-C),其中上皮细胞,分为15个簇,根据CNV(拷贝数变异)将其分为正常类别和肿瘤类别(图1D-F)。在恶性上皮细胞亚群内,PPP中的基因显著上调(图1G),且在上皮细胞从良性状态向恶性状态转变的过程中,PPP中限速酶(PGD、G6PD、TALDO1和TKT)的表达水平逐渐升高(图1H-I)。这些发现表明,PPP在LUAD的肿瘤发生和发展中起着关键作用。

图1 磷酸戊糖途径(PPP)在LUAD中被显著激活

(图源:Jun Wu., et al., Cancer Lett., 2024)

PGD在LUAD中高表达,并与不良预后相关

分析568例LUAD患者和545例LUSC患者的TCGA数据,发现PPP在LUSC和LUAD样本中显著富集(图2A-B),且四种限速酶(PGD、G6PD、TALDO1和TKT)的表达均显著升高(图2C),在LUAD患者中,PGD的高表达与不良预后相关。

构建组织芯片(TMA)对PGD进行染色,证实:在LUAD和LUSC患者的癌变组织中,PGD的表达量高于配对的正常组织。小鼠原位LUAD模型肿瘤和邻近正常组织IHC结果进一步证明,揭示PGD可能作为LUAD的致癌基因,加速LUAD的进展(图2I)。

图2 PGD在LUAD中高表达,并与不良预后相关

图源:Jun Wu., et al., Cancer Lett., 2024)

PGD促进LUAD细胞的增殖、迁移和侵袭

LUAD细胞中PGD的蛋白水平高于人正常肺支气管上皮细胞。构建敲除和过表达PGD细胞系,CCK-8证明PGD促进LUAD细胞增殖(图A-D),体外迁移和侵袭实验证明PGD促进LUAD细胞转移(图3F-G);

PGD抑制剂处理LUAD细胞,细胞活力剂量依赖性下降(图3H),且抑制其集落形成(图3I),降低其迁移和侵袭能力(图3K-L)。动物实验中也证实,敲除PGD显著抑制肿瘤生长(图3M-P)。

图3 PGD促进LUAD细胞的增殖、迁移和侵袭

(图源:Jun Wu., et al., Cancer Lett., 2024)

抑制PGD可降低酶活性,抑制糖酵解和脂肪酸合成

PGD敲除或抑制剂处理,降低细胞NADPH/NADP+比值(图4D),增加ROS水平(图4A-C)。KEGG发现PGD-high细胞在脂肪细胞因子信号通路和糖酵解通路中显著富集(图4E)。且敲除PGD显著抑制了乳酸的产生,降低糖酵解能力(图4F-G),Oil Red O染色显示,PGD显著促进了细胞的脂质积累(图4H)。这些发现提示PGD可能促进糖酵解和脂质代谢来驱动LUAD的进展。

图4 抑制PGD可降低酶活性,抑制糖酵解和脂肪酸合成

(图源:Jun Wu., et al., Cancer Lett., 2024)

PGD通过与IQGAP1竞争性地相互作用来抑制AMPK通路的激活

抑制PGD,LUAD细胞中的p-AMPK水平显著升高(图5A),利用蛋白互作组检测PGD互作蛋白(图5B-C),从中筛选出可以调控AMPK通路的关键蛋白IQGAP1(图5D),co-IP、免疫荧光染色证实了PGD与IQGAP1相互作用(图5E-G)。且发现PGD通过与IQGAP1其IQ域竞争性结合,阻止其与AMPKα结合而抑制AMPK磷酸化(图5H-J)。

图5 PGD通过与IQGAP1竞争性地相互作用来抑制AMPK通路的激活

(图源:Jun Wu., et al., Cancer Lett., 2024)

抑制AMPK通路可以恢复PGD敲除诱导的抗癌作用

敲除PGD能抑制LUAD细胞的增殖、迁移和侵袭,这种作用能被AMPK抑制剂逆转(图6A-D),而且敲除PGD所抑制糖酵解和脂肪酸合成,同样能被AMPK抑制剂逆转(图6E-H)。

图6 抑制AMPK通路可以恢复PGD敲除诱导的抗癌作用

(图源:Jun Wu., et al., Cancer Lett., 2024)

PGD具有作为一种新的、有效的LUAD治疗靶点的潜力

PGD特异性抑制剂与二甲双胍联合使用对体外肿瘤生长有协同抑制作用(图7B),且在肿瘤异种移植研究中得到证实(图7C-E)。另外该组合表现出最显著的AMPK通路激活(图7F),综上所述,PGD及其下游AMPK通路是治疗LUAD的潜在新靶点。

图7 PGD具有作为一种新的、有效的LUAD治疗靶点的潜力

(图源:Jun Wu., et al., Cancer Lett., 2024)

文章小结

异常代谢已成为癌症的一个显著特征,在肺腺癌(LUAD)的发生和发展中起着关键作用。在这项研究中,单细胞测序揭示,在恶性上皮细胞亚群的恶性进展过程中,代谢酶6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(PGD)显著上调;体外和体内分析发现,PGD敲除或抑制其活性可抑制LUAD细胞的增殖、迁移和侵袭;TCGA数据库分析和LUAD组织芯片数据发现PGD上升,并且与LUAD患者的不良预后密切相关,可作为潜在治疗靶点。

拜谱小结

研究首次揭示肺腺癌中IQGAP1是PGD的强有力的新型相互作用蛋白。PGD通过与已知的AMPKα结合伴侣IQGAP1的IQ域竞争性相互作用,降低了p-AMPK的水平,从而促进了LUAD细胞的糖酵解和脂肪酸合成。该研究成果中拜谱生物为其提供蛋白互作组的检测与分析拜谱生物已研发完成并建立了完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,欢迎致电咨询!

参考文献:

Wu J, Chen Y, Zou H, Xu K, Hou J, Wang M, Tian S, Gao M, Ren Q, Sun C, Lu S, Wang Q, Shu Y, Wang S, Wang X. 6-Phosphogluconate dehydrogenase promotes glycolysis and fatty acid synthesis by inhibiting the AMPK pathway in lung adenocarcinoma cells. Cancer Lett. 2024 Oct 1;601:217177. doi: 10.1016/j.canlet.2024.217177