4D蛋白质组-拜谱生物-蛋白组组学

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4D蛋白质组

在3D定量技术中，主要根据保留时间（Retention time）、质荷比（m/z）和强度（Intensity）三个维度的性质对肽段进行定性和定量。离子淌度（Ion Mobility）概念的引入使蛋白质组学进入了4D新时代，在m/z维度上无法分离的离子可以根据离子淌度得以分离。4D蛋白质组学基于timsTOF Pro质谱平台，将数据依赖性采集（DDA）、数据非依赖性采集（DIA）或平行反应监测（PRM）与同步累积连续碎裂（PASEF）技术相结合。第四维度的离子淌度依据离子大小和形状，或者更准确地说是离子的碰撞截面积（Collisional cross section，CCS）来实现对离子的分离，实现准确高效的4D定量蛋白质组学。4D-蛋白质组学以更少上样量，实现高速度、高灵敏度、高通量、高覆盖度的蛋白质组学检测，并在基础研究、转化医学、临床蛋白质组学等各个方面展现出了广阔的发展前景和强大的生命力。

4D-蛋白质组学示意图

4D蛋白质组

实验流程

应用场景与技术优势

产品

01

产品类型：4D-label free

采集模式以及应用方向：DDA+PASEF；适于各类样本，尤其是微量样品：细胞、血液、石蜡切片等
02

产品类型：4D-DIA

采集模式以及应用方向：DIA+PASEF；适于大规模样本研究：临床大对列样本等
03

产品类型：4D-PRM

采集模式以及应用方向：PRM + PASEF；非靶蛋白组学数据可靠性验证，biomarker或功能验证

送样建议

样本类型	4D--蛋白质组学
动物组织	>50mg
植物组织	>200mg
细胞样品	>1x10^7
血液、脑脊液等体液	>100μl
微生物类（菌类）	>50mg

参考文献

1.Tian W, Zhang N, Jin R, et al. Immune suppression in the early stage of COVID-19 disease. Nat Commun. 2020;11(1):5859. Published 2020 Nov 17. doi:10.1038/s41467-020-19706-9

2.Zandalinas SI, Song L, Sengupta S, et al. Expression of a dominant-negative AtNEET-H89C protein disrupts iron-sulfur metabolism and iron homeostasis in Arabidopsis. Plant J. 2020;101(5):1152-1169. doi:10.1111/tpj.14581

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