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代谢组+16s rDNA
微生物是自然界中分布最广、种类最多、数量最大的生物类群。以肠道微生物为例，人体内微生物的总数约是人体细胞总数的10倍——越来越多的研究发现，肠道微生物与人体健康有着密切的关系，而微生物产生的代谢物是这调控过程中最主要的中间递质之一。微生物组研究可以获得微生物群落组成及丰度信息，但是这些信息并不足以充分说明微生物是通过何种方式影响宿主或环境。微生物组-代谢组的联合分析可以用来解释差异菌群与差异代谢物的关联性，从而帮助建立微生物-代谢物-表型之间的逻辑关系。
代谢组+16s rDNA
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