当我们把焦距对准单个细胞：它发挥了什么功能，又受何调控？单细胞基因组学让我们看清了细胞间的异质性，但“基因表达不同”并不一定等于“代谢表型改变”。只有把“谁在表达”与“实际做了什么”放到同一张画面上，才算完成真正的功能解码。单细胞测序给出上游调控的地图，代谢组记录下游代谢的足迹；两条信息交汇，才能判断转录的指令是否落实为代谢的行动——这正是当下多组学整合的发展趋势。

组学“桥梁”从表达走向功能

从机制到功能的多组学闭环，展现在以下四个层面：

两种分析思路，解决两类常见场景

场景一、动物领域

已有代谢组数据，进一步想知道是哪些细胞、基因造成了代谢异常？

用单细胞测序验证表达有效性，构建机制-功能闭环

分析路径：

应用案例：

场景二、植物领域

已有单细胞测序数据，进一步想看表达变化是否转化为代谢功能？

用代谢组追溯来源机制，定位关键细胞亚群与调控因子

分析路径：

应用案例：

拜谱生物多组学一体化解决方案

拜谱生物已建立从单细胞测序到代谢组学的全流程检测平台，支持双向整合分析策略，可提供以下服务模块：

拜谱小结

单细胞转录组聚焦于细胞的“语言”——它告诉我们细胞正在表达哪些基因，是谁在调控谁，哪些通路被激活或抑制。代谢组学则揭示细胞的“行动”——它直接测量细胞内外的代谢产物，反映出细胞的能量状态、生理代谢水平及其功能表现。将单细胞转录组与代谢组数据整合分析，不只是“1+1>2”，而是在基因调控与功能结果之间形成闭环验证系统。拜谱生物可提供完善的单细胞测序检测服务，10xGenomics平台与墨卓平台并行，联合蛋白组、代谢组、修饰蛋白组学，实现一站式多组学联合分析，打开研究思路，构建因果故事链条。

参考文献

[1]Li H, Zhu L, Li Z, et al. Integrated Transcriptome and Metabolomics Analyses Show MYC as a Potential Therapeutic Target for Behçet's Uveitis. Adv Sci (Weinh). Published online June 30, 2025. doi:10.1002/advs.202417843

[2]Ge X, Yu X, Liu Z, et al. Spatiotemporal transcriptome and metabolome landscapes of cotton somatic embryos. Nat Commun. 2025;16(1):859. Published 2025 Jan 20. doi:10.1038/s41467-025-55870-6